ПЦР анализ мутаций в гене NPM1

Мутации в гене NPM1 являются самой распространенной генетической аберрацией при ОМЛ у взрослых людей (около 35 % всех случаев ОМЛ и около 60 % случаев ОМЛ с нормальным кариотипом). Являются прогностическим маркером при ОМЛ.

Синонимы русские

Мутации при остром миелоидном лейкозе (ОМЛ).

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Венозную кровь.

Как правильно подготовиться к исследованию?

• Специальной подготовки не требуется.

Название гена

NPM1.

OMIM

* 164040.

Локализация гена на хромосоме

5q35.1.

Общая информация об исследовании

Данное исследование позволяет методом полимеразной цепной реакции обнаружить аномалии в исследуемом гене.

Ген NPM1 расположен на длинном плече хромосомы 5 и отвечает за создание белка нуклеофосмина (ядрышковый фосфопротеид). Этот белок находится в небольшой области внутри ядра клетки, называемой ядрышком. Нуклеофосмин перемещается туда и обратно между ядром и окружающей жидкостью (цитоплазмой). Считается, что он играет роль во многих клеточных функциях, включая процессы, связанные с образованием белка, репликацией ДНК и клеточным циклом. В ядрышке нуклеофосмин соединяется с другим белком – ARF, сохраняя его в правильное местоположение и защищая от разрушения. Белок ARF считается опухолевым супрессором, потому что он вовлечен в процессы, которые препятствуют росту и делению клеток неконтролируемым образом.

Мутации в гене NPM1 связаны с различными онкологическими заболеваниями клеток крови, например с цитогенетически нормальным острым миелоидным лейкозом (НК-ОМЛ). В то время как большие хромосомные аномалии могут быть вовлечены в развитие острого миелоидного лейкоза, около половины случаев не имеют этих отклонений, они классифицируются как НК-ОМЛ. Примерно у 64 % людей с этой патологией есть мутация в гене NPM1. Такие аномалии называются соматическими мутациями. Они обнаруживаются только в клетках, которые становятся злокачественными и не наследуются. Эти мутации происходят в области гена, обозначенного экзоном 12. Они меняют схему, используемую для получения нуклеофосмина, приводя к образованию белка с измененной последовательностью аминокислот (чаще всего это касается триптофана в положениях 290 и 288). Новая последовательность приводит к тому, что нуклеофосмин оказывается в цитоплазме, а не в ядре.
До конца неясно, как аномальная локализация нуклеофосмина приводит к острой миелоидной лейкемии. Но исследования показывают, что он влияет на функцию белка ARF, который также встречается в цитоплазме клеток с этими генетическими изменениями. Кроме того, измененный нуклеофосмин не может защитить ARF от разрушения. Считается, что снижение функции опухолевого супрессора ARF приводит к неконтролируемому производству аномальных лейкоцитов, которые и появляются при остром миелоидном лейкозе. Другие эффекты мутаций гена NPM1 могут также участвовать в развитии лейкемии.
Генетическая перегруппировка (транслокация) с участием гена NPM1 обнаружена и при другом онкологическом заболевании крови, известном как анапластическая крупноклеточная лимфома (АККЛ). При данной патологии неконтролируемо растут и делятся Т-лимфоциты, часто образуя  опухоли в лимфатических узлах. Транслокация, связанная с АККЛ, известна как t (2; 5). Она соединяет часть гена NPM1 на хромосоме 5 с частью другого гена ALK (ген тирозинкиназы) на хромосоме 2. Эта перегруппировка является соматической мутацией. Белок, кодируемый геном слияния, называется Npml-Alk и состоит из нуклеофосмина и тирозинкиназы анапластической крупноклеточной лимфомы. Как и нормальный активированный белок ALK, он включает сигнальные пути, которые стимулируют рост и деление клеток (пролиферацию) и их созревание (дифференцировку). Но в отличие от ALK, белок Npml-Alk активен постоянно, что вызывает неконтролируемую пролиферацию клеток и приводит развитию АККЛ.

Кроме этого, установлена связь между наличием мутации в гене NPM1 и развитием миелодиспластического синдрома (МДС), а также значительно реже (в менее 2% случаев) данная аномалия встречается при остром промиелоцитарном лейкозе.

Для чего используется исследование?

• Для диагностики онкологических заболеваний, развитие которых связано с мутацией в исследуемом гене;
• для подбора рациональной схемы терапии;
• для прогноза течения и исхода заболевания.

Когда назначается исследование?

• На этапе генодиагностики при заболеваниях, в развитии которых может участвовать мутировавший NPM1;
• перед началом химиотерапии и при дальнейшем мониторинге терапии;
• при рецидиве заболевания, ассоциированного с мутацией NPM1.

Что означают результаты?

Референсные значения: мутация не обнаружена.

Также рекомендуется

18-101 ПЦР-анализ мутаций в гене FLT3 (ITD, TKD)

Кто назначает исследование?

Онколог, гематолог.