Исследование показано для выявления наследственных опухолевых синдромов (выявления наследственной предрасположенности к злокачественным новообразованиям).
Синонимы русские
Синдром Линча, наследственные полипозы желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), синдром Коудена, синдром Пейтца – Егерса, множественная эндокринная неоплазия (МЭН), туберозный склероз, опухоль Вильмса, синдром Перлмана, синдром Гиппеля – Линдау, факоматоз, нейрофиброматоз, шванноматоз, синдром Ли – Фраумени, наследственная ретинобластома, анемия Фанкони, атаксия-телеангиэктазия, синдром Блума, синдром Ниймегена, синдром Вискотта – Олдрича, синдром Швахмана – Даймонда, врожденный дискератоз, наследственный рак молочной железы и яичников, пигментная ксеродерма, синдром Нунан, синдром Костелло, RAS-патии, наследственный панкреатит, наследственная гастроинтестинальная стромальная опухоль, синдром DICER1, синдром Хаддад, HOXB13-наследственный рак предстательной железы.
Синонимы английские
Lynchsyndrome, Familial Adenomatous Polyposis, Cowdensyndrome, Peutz-Jegherssyndrome, multiple endocrine neoplasia,tuberous sclerosis, Wilms' tumor,Perlman syndrome,von Hippel-Lindau syndrome,phakomatosis, neurofibromatosis, schwannomatosis, Li-Fraumeni syndrome,hereditary retinoblastoma,Fanconi anemia,ataxia-telangiectasia,Bloom syndrome,Nijmegen syndrome, Wiskott-Aldrich syndrome,Shwachman-Diamond syndrome,dyskeratosis congenita,hereditary breast and ovarian cancer,xeroderma pigmentosum,Noonan syndrome,Costello syndrome, RASopathies, hereditary pancreatitis, hereditary gastrointestinal stromal tumor (GIST), DICER1 syndrome, Haddad syndrome, HOXB13-hereditary prostate cancer.
Название гена
Полный алфавитный список исследуемых генов данной панели предоставляется по запросу.
Метод исследования
Секвенирование следующего поколения (Next-Generation Sequencing, NGS).
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Венозная кровь.
Общая информация об исследовании
Наследственные опухолевые синдромы – группа заболеваний с повышенным риском развития злокачественных образований в течение жизни. Клинически наследственные опухолевые синдромы имеют ряд характерных черт: молодой возраст появления опухолей, более агрессивное течение, семейный анамнез болезни. Большинство наследственных опухолевых синдромов повышают риски развития злокачественных образований в нескольких локализациях.
Важным понятием в контексте наследственного рака является пенетрантность – вероятность развития заболевания при носительстве патогенного варианта в гене, изменения в котором предрасполагают к его появлению. При выявлении носительства патогенного варианта в одном из исследованных генов у пациента без выявленного злокачественного образования риск рака в течение жизни не равен 100 %. Вместе с тем выявление патогенного варианта при отсутствии опухоли позволяет изменить подходы к скринингу злокачественных образований у пациента и в некоторых случаях провести профилактические медицинские манипуляции, снижающие риск развития заболевания.
Выявление патогенного или вероятно патогенного варианта при идентифицированном опухолевом образовании значительно влияет на терапевтическую тактику (предполагает использование определенных схем химиотерапии, назначение таргетной терапии) и хирургическое лечение пациента, а также служит показанием к обследованию родственников первой линии больного.
Синдромы предрасположенности к полипам и раку желудочно-кишечного тракта: синдром Линча, наследственные полипозные синдромы (семейный аденоматозный полипоз, синдром Гарднера, синдром Тюрко и др.), синдром Коудена, синдром Пейтца – Егерса и некоторые другие синдромы.
Синдромы предрасположенности к эндокринным неоплазиям: множественная эндокринная неоплазия (характеризуется опухолевым поражением двух и более эндокринных желез) нескольких типов, синдром наследственной параганглиомы и феохромоцитомы, синдром Карнея и некоторые другие синдромы.
Синдромы предрасположенности к раку почки: туберозный склероз (болезнь Бурневилля), опухоль Вильмса (нефробластома), синдром Гиппеля – Линдау (VHL-синдром) и некоторые другие синдромы.
Факоматозы и нейрокутанные синдромы: нейрофиброматоз 1-го типа (болезнь Реклингхаузена), шванноматоз и вестибулярный шванноматоз.
Синдромы предрасположенности к саркомам и опухолям мягких тканей: синдром множественных экзостозов, синдром Ли – Фраумени (наследственный TP53-ассоциированный опухолевый синдром), наследственная ретинобластома и некоторые другие синдромы.
Синдромы предрасположенности к гематологическим злокачественным новообразованиям: анемия Фанкони; наследственный рак, ассоциированный с генами теломерного комплекса; атаксия-телеангиэктазия (синдром Луи-Бар); синдром Блума; синдром Ниймегена; синдром Вискотта – Олдрича и некоторые другие синдромы.
Синдромы предрасположенности к раку молочной железы и яичников. «Поломки» в генах гомологической рекомбинации (в т. ч. BRCA1 и BRCA2) ассоциированы с синдромом наследственного рака молочной железы и рака яичников. Также возможно развитие другой онкопатологии.
Синдромы предрасположенности к раку кожи и меланоме: пигментная ксеродерма, синдром Горлина – Гольца, синдром семейных атипичных невусов и меланомы и некоторые другие синдромы.
RAS-патии – это синдромы нарушения развития с онкологическим риском, среди которых синдром Нунан, синдром Костелло, кардиофациокожный синдром и некоторые другие синдромы.
Прочие синдромы с уникальными опухолевыми спектрами: наследственный панкреатит, HOXB13-наследственный рак предстательной железы, наследственная гастроинтестинальная стромальная опухоль (ГИСО, GIST), синдром Хаддад и др.
Таблица «Исследование панели генов наследственных опухолевых синдромов»
|
Синдромы предрасположенности к полипам и раку желудочно-кишечного тракта |
|
|
Синдром Линча |
EPCAM, EXO1, MLH1, MSH2, MSH6, PMS1, PMS2 |
|
Наследственные полипозы |
APC, BMPR1A, GREM1, MLH3, MSH3, MUTYH, POLD1, POLE, SMAD4 |
|
Синдром Коудена |
PTEN |
|
RPS20-ассоциированный наследственный неполипозный колоректальный рак |
RPS20 |
|
NTHL1-ассоциированный наследственный рак |
NTHL1 |
|
Наследственный синдром диффузного рака желудка и рака молочной железы |
CDH1, CTNNA1 |
|
Синдром олигодонтии-колоректального рака |
AXIN2 |
|
Синдром Пейтца – Егерса |
STK11 |
|
Синдром рака с зубчатым полипозом |
RNF43 |
|
Синдромы предрасположенности к эндокринным неоплазиям (множественная эндокринная неоплазия и др.) |
|
|
Множественная эндокринная неоплазия |
CDKN1B, MEN1, RET |
|
Синдром наследственной параганглиомы и феохромоцитомы |
DLST, MAX, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SLC25A11, TMEM127 |
|
Комплекс Карнея |
PRKAR1A |
|
Синдром гиперпаратиреоза с опухолью челюсти |
CDC73 |
|
Синдромы предрасположенности к раку почки |
|
|
Туберозный склероз |
TSC1, TSC2 |
|
Опухоль Вильмса |
POU6F2, REST, TRIM28, WT1 |
|
Синдром Перлмана |
DIS3L2 |
|
Синдром Гиппеля – Линдау |
VHL |
|
Наследственная папиллярная почечно-клеточная карцинома |
MET |
|
Наследственный лейомиоматоз и почечно-клеточный рак |
FH |
|
Синдром Бёрта – Хогг – Дюбе |
FLCN |
|
Факоматозы и нейрокутанные синдромы (нейрофиброматоз и шванноматоз) |
|
|
Нейрофиброматоз |
NF1, NF2 |
|
Шванноматоз |
LZTR1, SMARCB1 |
|
Синдромы предрасположенности к саркомам и опухолям мягких тканей |
|
|
Синдром множественных экзостозов |
EXT1, EXT2 |
|
Синдром Ли – Фраумени |
CHEK2, MDM2, TP53 |
|
Синдром Ротмунда – Томсона |
ANAPC1, CRIPT, DNA2, RECQL4 |
|
Синдром Вернера |
WRN |
|
Наследственная ретинобластома |
RB1 |
|
Синдром предрасположенности к рабдоидным опухолям (синдром Коффина – Сирис) |
SMARCA4, SMARCB1 |
|
Диафизарный медуллярный стеноз со злокачественной фиброзной гистиоцитомой |
MTAP |
|
Синдромы предрасположенности к гематологическим злокачественным новообразованиям |
|
|
Анемия Фанкони |
BRCA1, BRCA2, BRIP1, ERCC4, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2 и другие гены * |
|
Наследственный рак, ассоциированный с генами теломерного комплекса |
ACD, POT1, TERF2IP, TERT |
|
Атаксия-телеангиэктазия |
ATM |
|
Синдром Блума |
BLM |
|
Синдром Ниймегена |
NBN |
|
Синдром Вискотта – Олдрича |
WAS |
|
Синдром Швахмана – Даймонда |
SBDS |
|
Синдром Цинссера – Энгмана – Коула (врожденный дискератоз) |
DCLRE1B, DKC1, NHP2, NOP10, PARN, RTEL1, TERC, TINF2, WRAP53 |
|
Семейная тромбоцитопения / тромбоцитопатия с предрасположенностью к развитию острого миелоидного лейкоза |
RUNX1 |
|
Наследственный синдром предрасположенности к миелоидным новообразованиям |
DDX41 |
|
CEBPA-ассоциированные гематологические синдромы |
CEBPA |
|
Синдромы предрасположенности к раку молочной железы и яичников (гены HRR, в том числе BRCA1, BRCA2) |
|
|
Наследственный рак, ассоциированный с генами гомологической рекомбинации (HRR) |
ARID1A, ATM, ATRX, BAP1, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDK12, CHEK1, CHEK2 и другие гены * |
|
Синдромы предрасположенности к раку кожи и меланоме |
|
|
Пигментная ксеродерма |
DDB2, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERCC6, POLH, XPA, XPC |
|
Синдром Горлина – Гольца, или синдром базальноклеточного невуса |
PTCH1, SUFU |
|
Синдром семейных атипичных невусов и меланомы |
CDK4, CDKN2A |
|
Синдром Фергюсона-Смита (множественные самозаживающие эпителиомы) |
TGFBR1 |
|
Синдром Брука – Шпиглера |
CYLD |
|
RAS-патии (синдромы нарушения развития с онкологическим риском) |
|
|
Синдром Нунан |
BRAF , KRAS, LZTR1, MAPK1, MRAS, NRAS, PPP1CB , PTPN11, RAF1, RIT1 и другие гены * |
|
Синдром Легиуса |
SPRED1 |
|
Кардиофациокожный синдром |
BRAF, KRAS, MAP2K1, MAP2K2 |
|
Синдром Костелло |
HRAS |
|
Другие RAS-патии |
A2ML1, CBL, KAT6B, MAP3K8, PPP1CB, RASA1, RASA2, SHOC2, SYNGAP1 |
|
Прочие синдромы с уникальными опухолевыми спектрами (наследственный панкреатит, наследственная ГИСО, синдром Хаддад и др.) |
|
|
Наследственный панкреатит |
CASR, CAT, CEL, CELA3B, CFTR, CLDN2, CPA1, CTRC, GGT1, PNLIP, PRSS1, PRSS2 и другие гены * |
|
Наследственная гастроинтестинальная стромальная опухоль (GIST) |
KIT, PDGFRA |
|
Синдром DICER1 (DICER1-ассоциированный синдром) |
DICER1 |
|
Синдром Хаддад |
PHOX2B |
|
Семейная множественная менингиома |
SMARCE1 |
|
Наследственная предрасположенность к нейробластоме |
ALK, PHOX2B |
|
HOXB13- наследственный рак предстательной железы |
HOXB13 |
|
Cиндром Хауэл-Эванса |
RHBDF2 |
|
Синдром Секкеля 1-го типа и синдром семейной кожной телеангиэктазии и предрасположенности к раку ротоглотки |
ATR |
Для чего используется исследование?
Когда назначается исследование?
Что может влиять на результат?
Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~ 85 % известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет однонуклеотидные замены (SNV), малые инсерции/делеции (in/del) до 50 п. н., некоторые вариации числа копий (CNV).
Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся структурные изменения хромосом (инверсии, транслокации, делеции, амплификации), полиплоидии, анеуплоидии, варианты, ассоциированные с протяженными участками триплетных и других повторов, варианты в генах с наличием в геноме близкого по последовательности псевдогена или паралога, варианты в GC-богатых участках, варианты в интронах за пределами канонических сайтов сплайсинга, эпигенетические варианты.
Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.
Важные замечания
Для получения заключения по результату обследования необходимо проконсультироваться у клинического генетика.
Кто назначает исследование?
Онколог, генетик.
Литература
1) Рак ободочной кишки и ректосигмоидного перехода. Клинические рекомендации МЗ РФ. 2025 г. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/396_4.
2) Нейроэндокринные опухоли. Клинические рекомендации МЗ РФ. 2025 г. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/610_2.
3) Рак паренхимы почки. Клинические рекомендации МЗ РФ. 2025 г. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/10_5.
4) Л. А. Юсупова, Е. И. Юнусова, З. Ш. Гараева, Г. И. Мавлютова. Факоматозы: диагностика, клиника и особенности течения различных форм заболевания. Лечащий врач № 05, 2018.
5) Tamura R. Current Understanding of Neurofibromatosis Type 1, 2, and Schwannomatosis. IntJMolSci. 2021 May 29;22(11):5850. doi: 10.3390/ijms22115850.
6) Степанов, И., Васильева, Е., Соколенко, А., Имянитов, Е. (2022). Особенности наследственного TP53-ассоциированного опухолевого синдрома. Вопросы онкологии, 68(2), 140–148. https://doi.org/10.37469/0507-3758-2022-68-2-140-148.
7) Ретинобластома. Клинические рекомендации МЗ РФ. 2025 г. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/71_3.
8) Панферова А. В., Тимофеева Н. М., Ольшанская Ю. В. Генетическая диагностика анемии Фанкони. Обзор литературы // Онкогематология. - 2016. Т. 11. № 3. C. 76-85. doi: 10.17650/1818-8346-2016-11-3-76-85.
9) Рак молочной железы. Клинические рекомендации МЗ РФ. 2021 г. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/379_4.
10) Белышева Т. С., Наседкина Т. В., Клецкая И. С., Волкова А. С., Семенова В. В., Валиев Т. Т. Пигментная ксеродерма: клинико-генетические особенности и терапевтические подходы. Вопросы современной педиатрии. 2021;20(6s):611-617. https://doi.org/10.15690/vsp.v20i6S.2370.
11) Фаассен М.В. RAS-патии: синдром Нунан и другие родственные заболевания. Обзор литературы. Проблемы эндокринологии. 2014;60(6):45-52. https://doi.org/10.14341/probl201460645-52.
12) Гастроинтестинальные стромальные опухоли. Клинические рекомендации МЗ РФ. 2024 г. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/551_3.
13) OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man).